Współpraca nad wnioskami o otwarcie uczelni (jej trzech specjalności) ze środowiskami naukowymi Krakowa, Lublina i Rzeszowa, a następnie trwała obecność nauczycieli akademickich z tych środowisk w powstałej w 2001 roku Państwowej Wyższej Szkole Zawodowej w Przemyślu - w naturalny sposób sprzyjała nawiązaniu współpracy instytucjonalnej między PWSZ a tamtejszymi uczelniami akademickimi.
20 czerwca 2003 na mocy uchwał Senatu PWSZ zawarto kolejno: "Porozumienie" z Uniwersytetem Jagiellońskim. Dziś przedstawicielem UJ w Senacie i Konwencie PWSW jest prof. dr hab. Andrzej Chwalba.
"Umowę o współdziałaniu" z Uniwersytetem Marii Curie Skłodowskiej w Lublinie. Rektor prof. dr hab. Marian Harasimiuk wyznaczył swojego przedstawiciela do ciał kolegialnych uczelni w osobie prof. dr hab. Krzysztofa Stępnika. Przedstawicielem UMCS w Senacie PWSW jest dziś prof. dr hab. Jerzy Bartmiński.
12 sierpnia 2002 roku przemyska PWSZ zawarła "Porozumienie o współpracy" z Uniwersytetem Rzeszowskim. Jego ówczesny rektor prof. dr hab. Tadeusz Lulek wyznaczył na tej podstawie do Senatu i Konwentu naszej uczelni swego przedstawiciela w osobie prof. UR dr hab. Adama Czudeca, ówczesnego prorektora UR.
Uczelnia współpracuje także z Politechniką Rzeszowską.
